柯南、灰原及少年偵探隊(duì)成員步美、光彥、元太隨博士這日露營完畢,繞道參觀西多摩市新建于富士山前的日本第一雙塔摩天大樓,毛利小五郎恰也應(yīng)雙塔所有者、他的學(xué)妹常盤美緒之邀,攜小蘭、園子參加開幕典禮。美緒介紹下,他們認(rèn)識(shí)以畫富士山聞名的畫師如月峰水、市議員大木巖松、雙塔的設(shè)計(jì)者風(fēng)間英彥(森谷帝二的弟子,第一彈《引爆摩天樓》中,森谷曾向新一挑戰(zhàn))、天才程序員原。期間灰原的舉動(dòng)異常?! 〈竽咎崆叭胱塔被害,目暮警官著手調(diào)查發(fā)現(xiàn)他與美緒似有不同尋常關(guān)系,不久原亦被殺害于家中。因?yàn)楝F(xiàn)場(chǎng)都留有與日本畫畫師作畫時(shí)所用的乳缽相似的小酒杯碎片,兩起案件似系一人所為??履嫌尚【票?lián)想到灰原曾效力的、以酒名為綽號(hào)的黑暗組織,并注意到第二起案件中碎片上未沾染血跡。與此同時(shí)他找到灰原舉動(dòng)異常的原因,卻發(fā)現(xiàn)她正被人追蹤。而園子玩笑弄的發(fā)式令她像極了雪莉(灰原)?! ¢_幕酒會(huì)上,美緒向賓客展示如月最為寶貴的富士山畫作時(shí)被殺,死相正如橫亙?cè)诟皇可秸械碾p塔的縮影圖,她的身下也有一個(gè)小酒杯,不過卻是完好的。地上一顆原本該呆在美緒脖子上的珍珠令柯南將目光轉(zhuǎn)向如月。緊接,A樓美緒公司電腦檔案所在的樓層及地下配電室發(fā)生爆炸。逃亡時(shí)刻,柯南注意到正有一支槍瞄準(zhǔn)園子,心中給出了所有疑問的答案,但他及小蘭等人最迫切需要解決的卻是如何從火海逃脫。